En este título, el jugador toma el papel de dos protagonistas, un samurái rōnin llamado Hiba Kotaro y una kunoichi llamada Lin De Sekirei. El juego posee una mecánica muy similar a la de Resident Evil 2, los dos personajes se encuentran al principio del juego, y por motivos de fuerza mayor, se han de separar y proseguir su investigación por separado. Ahí es cuando el jugador tiene que escoger entre uno u otro. Cada personaje posee su propia historia dentro de la trama base del juego, pero ambas están relacionadas y los dos personajes se encontrarán en varios puntos de la aventura.