El mundo se encuentra en peligro debido a la resurrección del Dios del Mal, Dhaos. Los protagonistas lucharán en una batalla más allá del tiempo junto a Arche y Klarth (procedentes del pasado y poseedores de la extinguida magia en la línea temporal de Cless y el resto) y Suzu (una ninja del futuro que busca venganza contra Dhaos).
Juntos emprenderán un viaje para conocer los ocultos motivos e intenciones de Dhaos y acabar de una vez por todas con él.