Mega Man X4

Tras la tercera derrota de Sigma, los laboratorios del Dr. Cain empiezan una iniciativa para crear una fuerza militar para complementar a los Maverick Hunters. El ejército, llamado Repliforce, es un estricto régimen militar encabezado por el General y su segundo al mando, Colonel.

Seis meses después de la creación del grupo, los laboratorios del Dr. Cain consideran que sus métodos son ineficaces, cuestionables y potencialmente peligrosos contra la defensa de Mavericks y contra la humanidad misma.

Después de esto, un encapuchado misterioso se reúne con el General de la Repliforce para decirle que los Maverick Hunters los han considerado como una amenaza significante y que deben revelarse contra los humanos y los Maverick Hunters.

El juego comienza con la caída de Sky Lagoon, una ciudad flotante que se estrella con una ciudad que estaba debajo de ella. Matando a millones de civiles, seres humanos y Reploids por igual.