El argumento del juego transcurre en el Edificio Togusa. Éste ha sido secuestrado por una banda terrorista y han capturado como rehén al profesor Howard, un experto en biotecnología. El comando T.R.A.G. logra infiltrarse en el edificio, pero todos caen muertos. Solo sobreviven dos miembros, Alex Barrat y Michelle Stevenson, aunque dentro del edificio podrán formar equipo con hasta dos personajes más.