Mega Man X6

La historia comienza tres semanas después del juego Mega Man X5, un científico llamado Gate fue a explorar la zona de la colisión de Eurasia donde encontró ahí un objeto raro, un chip, que contenía el ADN de Zero. Al darse cuenta de las grandes posibilidades, lo lleva a su laboratorio para examinarlo, sin embargo y sin darse cuenta de ello, Gate es infectado con el virus llamado Zero Virus.

Aquí Isoc, quien es el ayudante de Gate, entra en el laboratorio y le da la idea de construir un robot más poderoso que cualquier otro, así nace High-Max en base del ADN de Zero. Debido al Virus Zero, Gate piensa crear una nación para los Reploids en el cual no existiesen los humanos.